菌類(lèi)的生物肥不僅在協(xié)助作物吸收磷、鋅及銅等礦質(zhì)元素方面有很強(qiáng)的作用，還有增強(qiáng)作物的吸水、保水以提高作物抗旱能力的作用。由于生物肥料能制造和協(xié)助作物吸收利用多種營(yíng)養(yǎng)元素，因此對(duì)農(nóng)產(chǎn)品的品質(zhì)有很大的改善，可以改變因施化肥產(chǎn)生的“瓜不香，果不甜，茶無(wú)味”的現(xiàn)狀，使農(nóng)產(chǎn)品各項(xiàng)指標(biāo)達(dá)到綠色食品的標(biāo)準(zhǔn)。從生物肥料的作用方式可以了解到。

長(zhǎng)期單純施用單質(zhì)化肥，使土壤微生物被抑制，有機(jī)質(zhì)含量逐年下降，化肥殘留，造成土壤板結(jié)，透水性、透氣性和吸光性變差，保肥能力降低。

單質(zhì)化肥利用率低和易造成土壤板結(jié)的缺點(diǎn)，淋溶、揮發(fā)、徑流和農(nóng)產(chǎn)品中有害物質(zhì)的殘留，不僅給人類(lèi)生存環(huán)境帶來(lái)污染，而且直接危害人體健康。

單純施用化肥，其增產(chǎn)效果已近極限，致使農(nóng)業(yè)投入不斷增加，加重了農(nóng)民負(fù)擔(dān)。

施肥量日益增長(zhǎng)，土壤結(jié)構(gòu)中有機(jī)質(zhì)比重下降，保水、供肥、通透能力和性能變差，板結(jié)嚴(yán)重，造成水土流失，生態(tài)失調(diào)。我國(guó)耕地墾殖年久遠(yuǎn)，加上長(zhǎng)期只重用地不顧養(yǎng)地，造成耕地養(yǎng)分失調(diào)，地力下降，雖然耕地產(chǎn)出量大幅度提高，但負(fù)荷過(guò)重，耕地養(yǎng)分投入與產(chǎn)出嚴(yán)重失衡。目前，除少數(shù)地區(qū)外，全國(guó)絕大多數(shù)耕地土壤肥力不高，土壤有機(jī)質(zhì)平均為1.8％左右，旱地僅為1％左右，而歐美等國(guó)的耕地土壤有機(jī)質(zhì)一般在5％—8％。而且我國(guó)很少種植有養(yǎng)地作用的多年生牧草，近年來(lái)綠肥的面積也下降很多，加之，有機(jī)肥（如：牛、馬、豬、雞等糞便發(fā)酵）的施用量也逐年遞減。